O Museu está instalado num edifício recuperado do século XVIII contíguo à Casa Municipal da Cultura, e integra uma construção principal com características de casa senhorial de quinta, e outra construção de desenho actual no prolongamento do edifício principal, e desenvolve-se em três pisos:

1.º piso
recepção (com arrecadação), átrio, serviços administrativos (uma sala para pessoal administrativo e uma sala para a coordenadora do museu), sanitários (2 femininos e 2 masculinos, com acesso a deficientes), elevador, dois espaços de exposição permanente (sala 1 - Evolução Histórica do Concelho e sala 2 - Geologia e Paleontologia), uma sala designada de "Museu Vivo" onde decorrem as actividades práticas e experimentais de trabalho na pedra e ateliers lúdico-pedagógicos (com sanitário e arrecadação). Este piso dispõe também de amplo jardim onde irão decorrer os Simpósios de Escultura na Pedra, de um espaço de reserva e um espaço de arrecadação.

2.º piso
um espaço de exposição permanente (sala Exploração e Trabalho da Pedra), um espaço de exposição temporária de estatuária antiga realizada em "pedra de Ançã", com espólio das igrejas e capelas do concelho (sala Esculturas) um espaço de conforto (Sala de Estar) com livros e catálogos de livre consulta e onde se podem ver filmes relacionados com o património do concelho de Cantanhede, e um amplo espaço para exposições temporárias de escultura contemporânea, geologia e paleontologia (sala Exposições Temporárias).

3.º piso
espaço lúdico-pedagógico/auditório, onde decorrem actividades dirigidas especialmente à comunidade escolar, sessões de cinema com filmes de temáticas afins ao Museu, jornadas, colóquios, congressos e outros eventos culturais.
Probabilidades de aumento da zona expositiva, da zona administrativa e do espaço de reservas do Museu para o edifício contíguo, que actualmente acolhe a Casa Municipal da Cultura.